Innere Alchemie bezieht sich auf Essenz, Qi (Lebensenergie) und Geist als die „Drei Schätze“ des menschlichen Körpers. Essenz, Qi und Geist werden weiter in angeborene und erworbene Typen unterteilt. Das sogenannte Angeborene bezieht sich auf die immateriellen, natürlichen und instinktiven Dinge, die die Grenzen von Zeit und Raum überschreiten, betrachtet aus dem ursprünglichen Zustand der Natur und der menschlichen Gesellschaft. Das sogenannte Erworbene bezieht sich auf die materiellen, von Menschen geschaffenen Dinge, die mit den Gesetzen der materiellen Bewegung übereinstimmen, betrachtet aus dem realistischen Zustand der materiellen Welt und der säkularen Gesellschaft. Als wesentliche Elemente des menschlichen Lebens haben Essenz, Qi und Geist nicht nur die Unterscheidung zwischen angeboren und erworben, sondern können auch ineinander umgewandelt werden.

Erworbene Essenz bezeichnet im engeren Sinne das beim menschlichen Geschlechtsverkehr ejakulierte Sperma; im weiteren Sinne umfasst sie auch verschiedene vom menschlichen Körper sezernierte Hormone. Angeborene Essenz, die instinktiv in einem Zustand des Nicht-Handelns entsteht, wird auch als „urzeitliche Essenz“ oder „wahre Essenz“ bezeichnet. Sie bezieht sich hauptsächlich auf die spontane sexuelle Funktion, die nicht durch Lust stimuliert wird; im weiteren Sinne umfasst sie auch die natürlichen Funktionen des endokrinen Systems, des Kreislaufsystems usw., die die Lebensvitalität anregen. Erworbenes Qi bezieht sich auf den Atem der Respiration; angeborenes Qi ist ursprüngliches Qi oder wahres Qi, geschrieben als „Qi“. Es ist ein Codename für die Kondensation von Essenz und Qi zu einer Einheit, die sich auf die Funktion menschlicher Lebensaktivitäten bezieht, verkörpert als ein hoch geordneter Energiefluss und physische Vitalität. Erworbener Geist ist der Geist des Denkens, der Geist der Kognition; angeborener Geist wird als ursprünglicher Geist bezeichnet (der aus der Umwandlung von ursprünglichem Qi in Geist entsteht, was das Ergebnis der Kondensation von Qi und Geist ist) und präsentiert einen extrem klaren Zustand des Nicht-Denkens. Essenz, Qi und Geist werden auch als die Medikamente für die Praxis der inneren Alchemie angesehen.